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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | nagC ![]() |
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Synonym(s): | ECK0664, EG10636, b0676, nagR | |
Genome position(nucleotides): | 700374 <-- 701594 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.99 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0002299 | |
CGSC: |
31479 | |
ECHOBASE: |
EB0630 | |
OU-MICROARRAY: |
b0676 | |
PortEco: |
nagC | |
STRING: |
511145.b0676 | |
COLOMBOS: | nagC |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator NagC | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | NagC, NagR, transcriptional repressor of nag (N-acetylglucosamine) operon | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | MarR | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 44.541 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.38 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [APPH] Assay of protein purified to homogeneity | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Condemine G., et al., 2005 [2] Peri KG., et al., 1990 [3] Plumbridge J. 2001 [4] Plumbridge J. 1995 [5] Plumbridge J., et al., 1991 [6] Plumbridge J., et al., 2004 [7] Plumbridge JA. 1991 [8] Plumbridge JA. 1989 [9] Sohanpal BK., et al., 2004 [10] Sohanpal BK., et al., 2007 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35984N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
PD00266 | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0676 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000835 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000600 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0AF20 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR18964 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00480 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01047 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0AF20 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023338 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01125 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415202 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0AF20 | ||||||||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0AF20 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0AF20 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_792 | 700355 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_793 | 701039 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_794 | 701340 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_795 | 701360 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_796 | 701362 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_797 | 701364 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_798 | 701606 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_799 | 701647 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_801 | 702710 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] |
Reference(s) |
![]() |
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