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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | srmB ![]() |
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Synonym(s): | ECK2574, EG10975, b2576, rbaB, rhlA | |
Genome position(nucleotides): | 2712896 --> 2714230 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
54.76 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008478 | |
CGSC: |
32859 | |
ECHOBASE: |
EB0968 | |
OU-MICROARRAY: |
b2576 | |
PortEco: |
srmB | |
STRING: |
511145.b2576 | |
COLOMBOS: | srmB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | ATP-dependent RNA helicase SrmB | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | DEAD-box RNA helicase, RbaB, RhlA, SrmB | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 49.914 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.823 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [IDA] Inferred from direct assay | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Arunasri K., et al., 2013 [2] Bizebard T., et al., 2004 [3] Jain C. 2018 [4] Sharma H., et al., 2016 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10920N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10975-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2576 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027417 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR028621 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014014 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014001 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011545 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001650 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000629 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1225512 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P21507 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2YJT | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00271 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00270 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P21507 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023988 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51194 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51195 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00039 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51192 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417071 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00490 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00487 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P21507 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P21507 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P21507 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | yfiCp3 | 2712805 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [5] | ||
promoter | srmBp4 | 2712876 | forward |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [5] | ||
promoter | TSS_2874 (cluster) | 2712878 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [6] |
Reference(s) |
![]() |
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