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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | htrE ![]() |
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Synonym(s): | ECK0138, EG11972, b0139 | |
Genome position(nucleotides): | 152829 <-- 155426 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
43.34 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000479 | |
CGSC: |
30510 | |
ECHOBASE: |
EB1915 | |
ECOLIHUB: |
htrE | |
OU-MICROARRAY: |
b0139 | |
STRING: |
511145.b0139 | |
COLOMBOS: | htrE |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative fimbrial usher protein HtrE | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | HtrE | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | outer membrane | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 95.499 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.647 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Korea CG., et al., 2010 [2] Korea CG., et al., 2011 [3] Larsonneur F., et al., 2016 [4] Raina S., et al., 1993 [5] Wurpel DJ., et al., 2013 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P33129 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9953N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11972-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0139 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025949 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR042186 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043142 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000015 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR037224 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025885 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018030 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR30451 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13954 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00577 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13953 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P33129 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022940 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01151 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414681 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P33129 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P33129 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | htrEp5 | 155438 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [6] | ||
promoter | htrEp1 | 155518 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [6] |
Reference(s) |
![]() |
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