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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | htrE ![]() |
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Synonym(s): | ECK0138, EG11972, b0139 | |
Genome position(nucleotides): | 152829 <-- 155426 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
43.34 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000479 | |
CGSC: |
30510 | |
ECHOBASE: |
EB1915 | |
OU-MICROARRAY: |
b0139 | |
PortEco: |
htrE | |
STRING: |
511145.b0139 | |
COLOMBOS: | htrE |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative fimbrial usher protein HtrE | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | HtrE | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | outer membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 95.499 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.647 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [HIFS] Human inference of function from sequence [IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Korea CG., et al., 2010 [2] Korea CG., et al., 2011 [3] Larsonneur F., et al., 2016 [4] Raina S., et al., 1993 [5] Wurpel DJ., et al., 2013 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9953N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11972-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0139 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018030 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR042186 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR037224 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025949 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025885 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000015 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1300601 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR30451 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13954 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13953 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00577 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P33129 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022940 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01151 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414681 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P33129 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P33129 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | htrEp5 | 155438 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [6] | ||
promoter | htrEp1 | 155518 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [6] |
Reference(s) |
![]() |
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