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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ccmF ![]() |
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Synonym(s): | ECK2188, EG12054, b2196, yejR | |
Genome position(nucleotides): | 2292961 <-- 2294904 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
57.1 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007269 | |
CGSC: |
36590 | |
ECHOBASE: |
EB1985 | |
ECOLIHUB: |
ccmF | |
OU-MICROARRAY: |
b2196 | |
STRING: |
511145.b2196 | |
COLOMBOS: | ccmF |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | holocytochrome c synthase CcmF component | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | CcmF, YejR, cytochrome c heme lyase, cytochrome c maturation protein F, cytochrome c synthetase | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 71.389 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.955 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IGI] Inferred from genetic interaction [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Ahuja U., et al., 2003 [2] San Francisco B., et al., 2014 [3] San Francisco B., et al., 2014 [4] Thony-Meyer L., et al., 1995 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P33927 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9256N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12054-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2196 | ||||||||||||||||||||||||
ECOO157CYC: |
CCMF-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002541 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003567 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR032523 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003568 | ||||||||||||||||||||||||
MINT: |
P33927 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01578 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF16327 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P33927 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR01411 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR01410 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022262 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416700 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P33927 | ||||||||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
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Name: | napFDAGHBC-ccmABCDEFGH | ||||||||||
Operon arrangement: |
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Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
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Display Regulation | |
Activated by: | FNR, ModE, FlhDC, NarP |
Repressed by: | NarL, NarP |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ccmHp1 | 2292621 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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