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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rtcR ![]() |
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Synonym(s): | ECK3408, EG12356, b3422, yhgB | |
Genome position(nucleotides): | 3558268 --> 3559866 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.78 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0011174 | |
ECHOBASE: |
EB2259 | |
ECOLIHUB: |
rtcR | |
OU-MICROARRAY: |
b3422 | |
STRING: |
511145.b3422 | |
COLOMBOS: | rtcR |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional activator RtcR | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | RtcR, YhgB | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Regulator Family: | EBP | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 60.299 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.102 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [GEA] Gene expression analysis [HIFS] Human inference of function from sequence |
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Reference(s): | [1] Genschik P., et al., 1998 | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10812N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12356-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b3422 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025943 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027417 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR017183 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR009715 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003593 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002078 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P38035 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR32071:SF14 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF06956 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00158 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P38035 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023893 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50045 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00676 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417880 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00382 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P38035 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P38035 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | rtcAp1 | 3556880 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | rtcAp6 | 3556948 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | rtcAp2 | 3557002 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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