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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rcsB ![]() |
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Synonym(s): | ECK2210, EG10821, b2217 | |
Genome position(nucleotides): | 2316177 --> 2316827 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
47.77 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007333 | |
CGSC: |
17977 | |
ECHOBASE: |
EB0814 | |
OU-MICROARRAY: |
b2217 | |
PortEco: |
rcsB | |
STRING: |
199310.c2760 | |
COLOMBOS: | rcsB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional activator RcsB | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | RcsB, RcsB response regulator | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | LuxR/UhpA | ||||||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 23.671 | ||||||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.761 | ||||||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [IE] Inferred from experiment | ||||||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Gottesman S., et al., 1991 [2] Hersch SJ., et al., 2020 [3] Pao GM., et al., 1995 [4] Parkinson JS. 1993 [5] Parkinson JS., et al., 1992 [6] Sledjeski DD., et al., 1996 [7] Stock JB., et al., 1990 [8] Stout V., et al., 1990 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-31861N | ||||||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
RCSB-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2217 | ||||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000792 | ||||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR030864 | ||||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR016032 | ||||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011006 | ||||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001789 | ||||||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P69407 | ||||||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5W43 | ||||||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5VXN | ||||||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5I4C | ||||||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00196 | ||||||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00072 | ||||||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0DMC7 | ||||||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00038 | ||||||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023690 | ||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50043 | ||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50110 | ||||||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00622 | ||||||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416721 | ||||||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00448 | ||||||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00421 | ||||||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0DMC7 | ||||||||||||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0DMC7 | ||||||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0DMC7 | ||||||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2489 (cluster) | 2316062 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2490 (cluster) | 2316172 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2491 | 2316181 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2492 | 2316184 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2493 | 2316190 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2494 (cluster) | 2316194 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2495 | 2316231 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2496 | 2316287 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2497 | 2317398 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2498 | 2317454 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2499 | 2319113 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] | ||
promoter | TSS_2500 | 2319298 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [9] |