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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | clpX ![]() |
|
Synonym(s): | ECK0432, EG10159, b0438, lopC | |
Genome position(nucleotides): | 457426 --> 458700 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.53 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0001517 | |
CGSC: |
31287 | |
ECHOBASE: |
EB0157 | |
OU-MICROARRAY: |
b0438 | |
PortEco: |
clpX | |
STRING: |
511145.b0438 | |
COLOMBOS: | clpX |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | ClpX, LopC | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 46.356 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.003 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: | |||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35907N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10159-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0438 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR038366 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003593 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003959 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027417 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004487 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR010603 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR019489 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A6H1 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR11262 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4I9K | ||||||||||||||||||
PDB: |
4I81 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4I63 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4I4L | ||||||||||||||||||
PDB: |
4I34 | ||||||||||||||||||
PDB: |
3HWS | ||||||||||||||||||
PDB: |
3HTE | ||||||||||||||||||
PDB: |
2DS8 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2DS7 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2DS6 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2DS5 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1OVX | ||||||||||||||||||
PDB: |
4I5O | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF07724 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF06689 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF10431 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A6H1 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022300 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51902 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414972 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00994 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM01086 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00382 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0A6H1 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0A6H1 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A6H1 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_576 | 457052 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_577 (cluster) | 457151 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_578 | 457171 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_580 | 457296 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_581 | 458066 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_582 | 458197 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_583 | 458293 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_584 | 458768 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_585 | 458780 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |