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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | glnS ![]() |
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Synonym(s): | ECK0668, EG10390, b0680 | |
Genome position(nucleotides): | 706093 --> 707757 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.49 | |
Note(s): | The glnS gene expression could be repressed in a direct or indirect way by the OmpR protein. Since, using gene arrray system, a repression of this gene was observed as a result of an up mutation in the ompR gene Brombacher E,2003. | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0002317 | |
CGSC: |
698 | |
ECHOBASE: |
EB0385 | |
MIM: |
615760 | |
OU-MICROARRAY: |
b0680 | |
PortEco: |
glnS | |
STRING: |
511145.b0680 | |
COLOMBOS: | glnS |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | glutamine—tRNA ligase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | GlnRS, GlnS | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 63.478 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.211 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Druart K., et al., 2017 | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9787N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
GLNS-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0680 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020056 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014729 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011035 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004514 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001412 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000924 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020061 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020058 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR022861 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020059 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1227909 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P00962 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR10119 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2RD2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2RE8 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4JXX | ||||||||||||||||||
PDB: |
4JXZ | ||||||||||||||||||
PDB: |
4JYZ | ||||||||||||||||||
PDB: |
1QTQ | ||||||||||||||||||
PDB: |
1QRU | ||||||||||||||||||
PDB: |
1QRT | ||||||||||||||||||
PDB: |
1QRS | ||||||||||||||||||
PDB: |
1O0C | ||||||||||||||||||
PDB: |
1O0B | ||||||||||||||||||
PDB: |
1NYL | ||||||||||||||||||
PDB: |
1GTS | ||||||||||||||||||
PDB: |
1GTR | ||||||||||||||||||
PDB: |
1GSG | ||||||||||||||||||
PDB: |
1EXD | ||||||||||||||||||
PDB: |
1EUY | ||||||||||||||||||
PDB: |
1EUQ | ||||||||||||||||||
PDB: |
1ZJW | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00749 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03950 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P00962 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00987 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00178 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415206 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P00962 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P00962 | ||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_809 | 706078 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_810 | 706086 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_811 | 706185 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_812 | 706250 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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