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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | lepA ![]() |
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Synonym(s): | ECK2567, EG10529, b2569 | |
Genome position(nucleotides): | 2705325 <-- 2707124 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.72 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008452 | |
CGSC: |
18199 | |
ECHOBASE: |
EB0524 | |
OU-MICROARRAY: |
b2569 | |
PortEco: |
lepA | |
STRING: |
511145.b2569 | |
COLOMBOS: | lepA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 30S ribosomal subunit biogenesis factor LepA | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | EF4, LepA, elongation factor 4 | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol,inner membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 66.57 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.258 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: | |||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [IDA] Inferred from direct assay [IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Gibbs MR., et al., 2017 [2] Liu H., et al., 2011 [3] Liu H., et al., 2010 [4] Pech M., et al., 2011 [5] Qin Y., et al., 2006 [6] Sergiev PV., et al., 2012 [7] Woolstenhulme CJ., et al., 2013 [8] Xie P. 2013 [9] Zhang D., et al., 2012 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-29868N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10529-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2569 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000795 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR038363 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR035654 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR035647 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR031157 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027417 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013842 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006297 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005225 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004161 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000640 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1225739 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P60785 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR23115:SF40 | ||||||||||||||||||
PDB: |
3JCE | ||||||||||||||||||
PDB: |
3CB4 | ||||||||||||||||||
PDB: |
3DEG | ||||||||||||||||||
PDB: |
3JCD | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00679 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00009 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03144 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF06421 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P60785 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00315 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023079 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00301 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51722 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417064 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00838 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P60785 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P60785 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P60785 | ||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | lepBp1 | 2705464 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [10] | ||
promoter | TSS_2866 | 2706051 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_2867 | 2707204 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [11] | ||
promoter | TSS_2868 (cluster) | 2707211 | reverse |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [11] |
Reference(s) |
![]() |
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