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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | murD ![]() |
|
Synonym(s): | ECK0089, EG10620, b0088 | |
Genome position(nucleotides): | 97087 --> 98403 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
54.9 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000318 | |
CGSC: |
30450 | |
ECHOBASE: |
EB0615 | |
OU-MICROARRAY: |
b0088 | |
PortEco: |
murD | |
STRING: |
511145.b0088 | |
COLOMBOS: | murD |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine—D-glutamate ligase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | MurD | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 46.974 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.965 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10279N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
UDP-NACMURALA-GLU-LIG-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0088 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005762 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004101 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013221 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036615 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036565 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1269366 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P14900 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR23135:SF2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2UUP | ||||||||||||||||||
PDB: |
2VTD | ||||||||||||||||||
PDB: |
2VTE | ||||||||||||||||||
PDB: |
2WJP | ||||||||||||||||||
PDB: |
2X5O | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XPC | ||||||||||||||||||
PDB: |
2Y1O | ||||||||||||||||||
PDB: |
2Y67 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2Y68 | ||||||||||||||||||
PDB: |
3UAG | ||||||||||||||||||
PDB: |
4UAG | ||||||||||||||||||
PDB: |
5A5E | ||||||||||||||||||
PDB: |
5A5F | ||||||||||||||||||
PDB: |
2UUO | ||||||||||||||||||
PDB: |
2UAG | ||||||||||||||||||
PDB: |
2JFH | ||||||||||||||||||
PDB: |
2JFG | ||||||||||||||||||
PDB: |
2JFF | ||||||||||||||||||
PDB: |
1UAG | ||||||||||||||||||
PDB: |
1EEH | ||||||||||||||||||
PDB: |
1E0D | ||||||||||||||||||
PDB: |
2Y66 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02875 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF08245 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P14900 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023315 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414630 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P14900 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P14900 | ||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||||||||||
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Name: | mraZ-rsmH-ftsLI-murEF-mraY-murD-ftsW-murGC-ddlB-ftsQAZ-lpxC | ||||||||||||||||||||||||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_162 | 96153 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_163 (cluster) | 96971 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_164 | 96982 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_165 | 96984 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_166 | 96988 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_167 | 96993 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_168 | 96997 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_169 | 97532 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_170 | 97539 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_171 | 97550 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_172 | 100621 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |