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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | prfA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1199, EG10761, b1211, sueB, uar, ups? | |
Genome position(nucleotides): | 1265012 --> 1266094 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.0 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0004066 | |
CGSC: |
14922 | |
ECHOBASE: |
EB0754 | |
OU-MICROARRAY: |
b1211 | |
PortEco: |
prfA | |
STRING: |
511145.b1211 | |
COLOMBOS: | prfA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | peptide chain release factor RF1 | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | PrfA, SueB, Uar | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 40.517 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.914 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [APPH] Assay of protein purified to homogeneity [IE] Inferred from experiment |
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Reference(s): |
[1] Baggett NE., et al., 2017 [2] Florin T., et al., 2017 [3] Lajoie MJ., et al., 2013 [4] Mora L., et al., 2007 [5] Scolnick E., et al., 1968 [6] Shaw JJ., et al., 2007 [7] Wei Y., et al., 2016 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35936N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10761-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1211 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004373 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005139 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000352 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1219241 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A7I0 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5O2R | ||||||||||||||||||
PDB: |
5J4D | ||||||||||||||||||
PDB: |
5J3C | ||||||||||||||||||
PDB: |
5J30 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2B3T | ||||||||||||||||||
PDB: |
6GWT | ||||||||||||||||||
PDB: |
6GXO | ||||||||||||||||||
PDB: |
6GXN | ||||||||||||||||||
PDB: |
6GXM | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03462 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00472 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A7I0 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023588 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00745 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415729 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00937 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0A7I0 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0A7I0 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A7I0 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1543 (cluster) | 1264894 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1544 (cluster) | 1264899 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1545 | 1265281 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1546 | 1265487 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1547 (cluster) | 1267181 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1548 | 1267190 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] |
Reference(s) |
![]() |
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