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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | relA ![]() |
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Synonym(s): | ECK2778, EG10835, RC, b2784 | |
Genome position(nucleotides): | 2911417 <-- 2913651 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.78 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0009125 | |
CGSC: |
306 | |
ECHOBASE: |
EB0828 | |
OU-MICROARRAY: |
b2784 | |
PortEco: |
relA | |
STRING: |
511145.b2784 | |
COLOMBOS: | relA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | GDP/GTP pyrophosphokinase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | (p)ppGpp synthetase I, PSI, RelA, ppGpp synthase I, ppGpp synthetase I, stringent factor | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 83.876 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.751 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Brown A., et al., 2016 | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10658N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
RELA-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2784 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002912 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR033655 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012676 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012675 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007685 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004811 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004095 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003607 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0AG20 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR21262 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR21262:SF1 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5KPX | ||||||||||||||||||
PDB: |
5KPW | ||||||||||||||||||
PDB: |
5KPV | ||||||||||||||||||
PDB: |
5KPS | ||||||||||||||||||
PDB: |
5IQR | ||||||||||||||||||
PDB: |
5L3P | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13291 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02824 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04607 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0AG20 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023710 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51831 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51880 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51671 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417264 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00954 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0AG20 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0AG20 | ||||||||||||||||||
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
---|---|
Display Regulation | |
Activated by: | CRP, H-NS, NtrC |
Repressed by: | HipAB, HipB |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_3085 | 2913146 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_3086 | 2913158 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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