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Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | rplR ![]() |
|
Synonym(s): | ECK3291, EG10879, b3304 | |
Genome position(nucleotides): | 3445244 <-- 3445597 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.67 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0010825 | |
CGSC: |
248 | |
ECHOBASE: |
EB0872 | |
ECOLIHUB: |
rplR | |
OU-MICROARRAY: |
b3304 | |
STRING: |
511145.b3304 | |
COLOMBOS: | rplR |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 50S ribosomal subunit protein L18 | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | RplR | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | ribosome,cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 12.77 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 11.067 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Hwang J., et al., 2006 [2] Korepanov AP., et al., 2012 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-47908N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10879-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b3304 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004389 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005484 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0C018 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR12899 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1ML5 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2J28 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2RDO | ||||||||||||||||||
PDB: |
3BBX | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
3J9Y | ||||||||||||||||||
PDB: |
3J9Z | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
4V76 | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
4V9P | ||||||||||||||||||
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PDB: |
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PDB: |
4WWW | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YBB | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
5IQR | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
5JC9 | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
5KCS | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
5KPV | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
5WE6 | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
6OST | ||||||||||||||||||
PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
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PDB: |
6TC3 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00861 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0C018 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023824 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417763 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0C018 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0C018 | ||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||
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Name: | rplNXE-rpsNH-rplFR-rpsE-rpmD-rplO-secY-rpmJ | ||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_3729 | 3444805 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3730 | 3444813 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3731 | 3445015 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3732 | 3445295 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3733 (cluster) | 3445304 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3734 | 3445418 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3735 | 3445426 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3736 | 3445428 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3737 | 3445466 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3738 | 3445546 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3739 | 3445611 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3740 | 3445620 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3741 | 3445623 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3742 (cluster) | 3445658 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3743 (cluster) | 3445685 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3744 (cluster) | 3445691 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3745 | 3445699 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3746 | 3445701 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3747 | 3445710 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3748 | 3445872 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3749 (cluster) | 3446058 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] |
Reference(s) |
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