![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | rpoD ![]() |
|
Synonym(s): | ECK3057, EG10896, alt, b3067 | |
Genome position(nucleotides): | 3213047 --> 3214888 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.99 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0010070 | |
CGSC: |
231 | |
ECHOBASE: |
EB0889 | |
OU-MICROARRAY: |
b3067 | |
PortEco: |
rpoD | |
STRING: |
511145.b3067 | |
COLOMBOS: | rpoD |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | sigma;70, Alt, RpoD, sigma 70 factor, sigma D factor | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 70.263 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.418 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Silverstone AE., et al., 1972 [2] Zhi H., et al., 2003 |
||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10773N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
RPOD-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b3067 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000943 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007127 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007624 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007627 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007630 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007631 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR042189 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012760 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013324 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013325 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014284 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR028630 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR009042 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1220595 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P00579 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1SIG | ||||||||||||||||||
PDB: |
1TLH | ||||||||||||||||||
PDB: |
6P18 | ||||||||||||||||||
PDB: |
6K4Y | ||||||||||||||||||
PDB: |
6JNX | ||||||||||||||||||
PDB: |
6CUX | ||||||||||||||||||
PDB: |
6CA0 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2P7V | ||||||||||||||||||
PDB: |
3IYD | ||||||||||||||||||
PDB: |
3T72 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4JK1 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4JK2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4JKR | ||||||||||||||||||
PDB: |
4KMU | ||||||||||||||||||
PDB: |
4KN4 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4KN7 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4LJZ | ||||||||||||||||||
PDB: |
4LK0 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4LK1 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4LLG | ||||||||||||||||||
PDB: |
4MEX | ||||||||||||||||||
PDB: |
4MEY | ||||||||||||||||||
PDB: |
4XSX | ||||||||||||||||||
PDB: |
4XSY | ||||||||||||||||||
PDB: |
4XSZ | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YFK | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YFN | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YFX | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YG2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YLN | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YLO | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YLP | ||||||||||||||||||
PDB: |
4ZH2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4ZH3 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4ZH4 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5UAC | ||||||||||||||||||
PDB: |
5UAG | ||||||||||||||||||
PDB: |
5UAH | ||||||||||||||||||
PDB: |
5UAJ | ||||||||||||||||||
PDB: |
5UAL | ||||||||||||||||||
PDB: |
5UAQ | ||||||||||||||||||
PDB: |
5VSW | ||||||||||||||||||
PDB: |
5VT0 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5W1S | ||||||||||||||||||
PDB: |
5W1T | ||||||||||||||||||
PDB: |
6B6H | ||||||||||||||||||
PDB: |
6BYU | ||||||||||||||||||
PDB: |
6C9Y | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04542 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04539 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03979 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00140 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04545 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04546 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P00579 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00046 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023847 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00715 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00716 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417539 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P00579 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P00579 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P00579 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_3372 | 3212730 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3373 | 3212852 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3374 (cluster) | 3212941 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3375 | 3213189 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3376 | 3213454 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_3377 | 3214325 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|