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Gene | ![]() ![]() |
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---|---|---|
Name: | rpsT ![]() |
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Synonym(s): | ECK0024, EG10919, b0023, sup(s20), supS, supS20 | |
Genome position(nucleotides): | 20815 <-- 21078 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
46.59 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000082 | |
CGSC: |
212 | |
ECHOBASE: |
EB0912 | |
OU-MICROARRAY: |
b0023 | |
PortEco: |
rpsT | |
STRING: |
511145.b0023 | |
COLOMBOS: | rpsT |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 30S ribosomal subunit protein S20 | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | RpsT, SupS | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | ribosome,cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 9.684 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 11.828 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Daya-Grosjean L., et al., 1974 [2] Ungewickell E., et al., 1975 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35857N | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10919-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0023 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002583 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036510 | ||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR33398 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
1M5G | ||||||||||||||||||||
PDB: |
2YKR | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3J9Y | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3J9Z | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JA1 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JBU | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JBV | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JCD | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JCE | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JCJ | ||||||||||||||||||||
PDB: |
3JCN | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4A2I | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4ADV | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U1U | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U1V | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U20 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U24 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U25 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U26 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4U27 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V47 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V48 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V4H | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V4Q | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V4V | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V4W | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V50 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V52 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V53 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V54 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V55 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V56 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V57 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V5B | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V5H | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V5Y | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V64 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V65 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V66 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V69 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6C | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6D | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6E | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6K | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6L | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6M | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6N | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6O | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6P | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6Q | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6R | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6S | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6T | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6V | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6Y | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V6Z | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V70 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V71 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V72 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V73 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V74 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V75 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V76 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V77 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V78 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V79 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7A | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7B | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7C | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7D | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7I | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7S | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7T | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7U | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V7V | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V85 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V89 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V9C | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V9D | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V9O | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4V9P | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4WF1 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4WOI | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4WWW | ||||||||||||||||||||
PDB: |
4YBB | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5AFI | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5H5U | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5IQR | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5IT8 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5J5B | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5J7L | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5J88 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5J8A | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5J91 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5JC9 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5JTE | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5JU8 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5KCR | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5KCS | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5KPS | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5KPV | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5KPW | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5KPX | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5L3P | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5LZA | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5LZB | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5LZC | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5LZD | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5LZE | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5LZF | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5MDV | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5MDW | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5MDY | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5MDZ | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5ME0 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5ME1 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5MGP | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5MY1 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5NO2 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5NO3 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5NO4 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5NP6 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5NWY | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5O2R | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5U4I | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5U9F | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5U9G | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UYK | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UYL | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UYM | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UYN | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UYP | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UYQ | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5UZ4 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5WDT | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5WE4 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5WE6 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
5WFK | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6BU8 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6BY1 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6C4I | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6ENF | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6ENJ | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6ENU | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6GWT | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6GXM | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6GXN | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6GXO | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6GXP | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6H4N | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6H58 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6HRM | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6I7V | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6OFX | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6OG7 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6Q97 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6Q98 | ||||||||||||||||||||
PDB: |
6Q9A | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01649 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A7U7 | ||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023873 | ||||||||||||||||||||
PRODOM: |
PD004231 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414564 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A7U7 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A7U7 | ||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_44 (cluster) | 20342 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_45 (cluster) | 20678 | reverse |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_46 | 20910 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
transcriptional_attenuator | anti-anti-terminator | 20912 | 20935 | forward | nd | nd | nd | |
transcriptional_attenuator | anti-terminator | 20912 | 20955 | forward | nd | nd | nd | |
transcriptional_attenuator | terminator | 20937 | 20982 | forward | nd | nd | nd | |
promoter | TSS_47 | 21020 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_48 | 21045 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_49 | 21094 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_50 | 21098 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_51 | 21112 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_53 | 21155 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_54 | 21157 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_55 | 21159 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_56 (cluster) | 21208 | reverse |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [3] |
Reference(s) |
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