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Gene | ![]() ![]() |
|
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Name: | serC ![]() |
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Synonym(s): | ECK0898, EG10946, b0907, pdxC, pdxF | |
Genome position(nucleotides): | 957653 --> 958741 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
50.14 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003093 | |
CGSC: |
171 | |
ECHOBASE: |
EB0939 | |
MIM: |
610992 | |
MIM: |
616038 | |
OU-MICROARRAY: |
b0907 | |
PortEco: |
serC | |
STRING: |
511145.b0907 | |
COLOMBOS: | serC |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | phosphoserine/phosphohydroxythreonine aminotransferase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | PdxC, PdxF, SerC | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 39.783 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.258 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Grant GA. 2018 [2] Gu P., et al., 2014 [3] Ivancic T., et al., 2013 [4] Mundhada H., et al., 2016 [5] Smallbone K., et al., 2013 [6] Wintermute EH., et al., 2010 [7] Zhang Y., et al., 2019 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-2896N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
PSERTRANSAM-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0907 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR022278 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020578 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015424 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015422 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015421 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000192 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1249760 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P23721 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR21152:SF1 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1BJO | ||||||||||||||||||
PDB: |
1BJN | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00266 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P23721 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00595 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415427 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P23721 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P23721 | ||||||||||||||||||
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
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Display Regulation | |||||||||||||||||||||||||
Activated by: | Lrp | ||||||||||||||||||||||||
Repressed by: | CRP | ||||||||||||||||||||||||
Growth Conditions: |
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Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1171 | 957585 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1172 | 957945 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1173 | 958104 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1174 | 958585 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1175 | 958602 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1176 | 958749 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_1177 (cluster) | 958751 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [8] |
Reference(s) |
![]() |
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