![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | srlR ![]() |
|
Synonym(s): | ECK2702, EG10974, b2707, gutR | |
Genome position(nucleotides): | 2829047 --> 2829820 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
48.84 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008900 | |
CGSC: |
152 | |
ECHOBASE: |
EB0967 | |
OU-MICROARRAY: |
b2707 | |
PortEco: |
srlR | |
STRING: |
511145.b2707 | |
COLOMBOS: | srlR |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | DNA-binding transcriptional repressor SrlR | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | GutR, SrlR | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Regulator Family: | DeoR | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 28.236 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.016 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [HIFS] Human inference of function from sequence [IEP] Inferred from expression pattern |
||||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Yamada M., et al., 1988 | ||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10919N | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
PD00283 | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2707 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR018356 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR037171 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014036 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001034 | ||||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1226226 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P15082 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00455 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF08220 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P15082 | ||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023987 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51000 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00894 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417187 | ||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00420 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P15082 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P15082 | ||||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | srlAEBD-gutM-srlR-gutQ | ||||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_3017 (cluster) | 2828961 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_3018 (cluster) | 2829709 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_3019 | 2829746 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|