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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | fimZ ![]() |
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Synonym(s): | ECK0528, EG11103, b0535, ybcA | |
Genome position(nucleotides): | 563848 <-- 564480 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
36.65 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0001836 | |
ECHOBASE: |
EB1095 | |
OU-MICROARRAY: |
b0535 | |
PortEco: |
fimZ | |
STRING: |
511145.b0535 | |
COLOMBOS: | fimZ |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative LuxR family transcriptional regulator FimZ | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | FimZ, YbcA | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 23.664 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.033 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [IEP] Inferred from expression pattern [IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Domka J., et al., 2007 [2] Hirakawa H., et al., 2003 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-48119N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11103-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0535 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001789 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR016032 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011006 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000792 | ||||||||||||||||||
MINT: |
MINT-1275851 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0AEL8 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00072 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00196 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0AEL8 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00038 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022625 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00622 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50110 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50043 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415068 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00448 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00421 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0AEL8 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0AEL8 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_681 | 564377 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | fimZp3 | 564607 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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