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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ahpF ![]() |
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Synonym(s): | ECK0600, EG11385, b0606 | |
Genome position(nucleotides): | 639753 --> 641318 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.13 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0002093 | |
CGSC: |
31194 | |
ECHOBASE: |
EB1358 | |
OU-MICROARRAY: |
b0606 | |
PortEco: |
ahpF | |
STRING: |
511145.b0606 | |
COLOMBOS: | ahpF |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | alkyl hydroperoxide reductase, AhpF component | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | AhpF, alkyl hydroperoxide reductase, F52a subunit | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 56.177 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.397 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Gomez-Sagasti MT., et al., 2014 [2] Ling J., et al., 2012 [3] Smillie DA., et al., 1992 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9077N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11385-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0606 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036249 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036188 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023753 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012336 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012081 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008255 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002109 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P35340 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YKF | ||||||||||||||||||
PDB: |
4YKG | ||||||||||||||||||
PDB: |
4XVG | ||||||||||||||||||
PDB: |
4O5U | ||||||||||||||||||
PDB: |
1FL2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4O5Q | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13192 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF07992 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P35340 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00469 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022071 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00573 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51354 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415139 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P35340 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P35340 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P35340 | ||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_737 | 638966 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_738 | 638974 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_739 | 639004 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_740 | 639027 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_741 | 639070 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_742 | 639766 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_743 (cluster) | 640123 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_744 | 640189 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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