![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | ccmF ![]() |
|
Synonym(s): | ECK2188, EG12054, b2196, yejR | |
Genome position(nucleotides): | 2292961 <-- 2294904 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
57.1 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007269 | |
CGSC: |
36590 | |
ECHOBASE: |
EB1985 | |
OU-MICROARRAY: |
b2196 | |
PortEco: |
ccmF | |
STRING: |
511145.b2196 | |
COLOMBOS: | ccmF |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | holocytochrome c synthetase membrane subunit CcmF | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | CcmF, YejR | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 71.389 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.955 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9256N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12054-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2196 | ||||||||||||||||||
ECOO157CYC: |
CCMF-MONOMER | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003568 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003567 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002541 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR032523 | ||||||||||||||||||
MINT: |
P33927 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR30009:SF0 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01578 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF16327 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P33927 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR01411 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR01410 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022262 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416700 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P33927 | ||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | napFDAGHBC-ccmABCDEFGH | ||||||||||
Operon arrangement: |
|
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
---|---|
Display Regulation | |
Activated by: | FNR, NarP, FlhDC, ModE |
Repressed by: | NarL, NarP |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | ccmHp1 | 2292621 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [1] |