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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | amiD ![]() |
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Synonym(s): | ECK0858, G6452, b0867, ybjR | |
Genome position(nucleotides): | 904913 --> 905743 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
56.08 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0002947 | |
ECHOBASE: |
EB3451 | |
OU-MICROARRAY: |
b0867 | |
PortEco: |
amiD | |
STRING: |
511145.b0867 | |
COLOMBOS: | amiD |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase D | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | AmiD, YbjR | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | outer membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 31.072 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.775 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Kerff F., et al., 2010 [2] Pennartz A., et al., 2009 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6452-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0867 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002502 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036366 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036505 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036365 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P75820 | ||||||||||||||||||
PDB: |
3D2Z | ||||||||||||||||||
PDB: |
3D2Y | ||||||||||||||||||
PDB: |
2WKX | ||||||||||||||||||
PDB: |
2BH7 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01510 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P75820 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022093 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51257 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415388 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00644 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P75820 | ||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P75820 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P75820 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1017 | 904477 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_1019 | 904520 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_1020 (cluster) | 904522 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_1021 (cluster) | 904530 | forward |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | ybjSp3 | 906898 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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