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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | pgaA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1014, G6531, b1024, hmsH, ycdS | |
Genome position(nucleotides): | 1089866 <-- 1092289 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
47.32 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003469 | |
ECHOBASE: |
EB3625 | |
OU-MICROARRAY: |
b1024 | |
PortEco: |
pgaA | |
STRING: |
511145.b1024 | |
COLOMBOS: | pgaA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | partially deacetylated poly-β-1,6-N-acetyl-D-glucosamine outer membrane porin | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | HmsH, PgaA, YcdS | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | outer membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 92.207 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.561 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Agladze K., et al., 2005 [2] Samoilova Z., et al., 2019 [3] Wang Y., et al., 2016 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6531-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1024 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013026 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023870 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR019734 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011990 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4Y25 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P69434 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023520 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50293 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50005 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415543 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00028 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P69434 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P69434 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1319 | 1092840 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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