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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ldcA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1180, G6621, b1192, ycgQ | |
Genome position(nucleotides): | 1242166 <-- 1243080 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.01 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0004002 | |
ECHOBASE: |
EB3657 | |
ECOO157CYC: |
Z1955 | |
OU-MICROARRAY: |
b1192 | |
PortEco: |
ldcA | |
STRING: |
511145.b1192 | |
COLOMBOS: | ldcA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | murein L,D-carboxypeptidase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | LdcA, YcgQ | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 33.567 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.576 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Beck BD., et al., 1977 [2] Beck BD., et al., 1976 [3] Metz R., et al., 1986 [4] Metz R., et al., 1986 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10085N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6621-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1192 | ||||||||||||||||||
ECOO157CYC: |
Z1955-MONOMER | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027461 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR040921 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR040449 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029062 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027478 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003507 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR30237 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5Z01 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5Z03 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02016 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF17676 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P76008 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023074 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415710 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P76008 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P76008 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1517 | 1242102 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | cvrAp6 | 1242164 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [6] | ||
promoter | TSS_1518 (cluster) | 1243112 | reverse |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | emtAp4 | 1243125 | forward |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [6] | ||
promoter | TSS_1519 | 1243161 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | ldcAp9 | 1243197 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [6] | ||
promoter | TSS_1520 | 1243371 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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