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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | slyA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1638, G6882, b1642 | |
Genome position(nucleotides): | 1720390 <-- 1720824 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
48.28 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0005495 | |
ECHOBASE: |
EB3184 | |
OU-MICROARRAY: |
b1642 | |
PortEco: |
slyA | |
STRING: |
511145.b1642 | |
COLOMBOS: | slyA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator SlyA | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | SlyA | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Regulator Family: | MarR | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 16.353 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.161 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [IE] Inferred from experiment | ||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Ludwig A., et al., 1999 [2] Spory A., et al., 2002 [3] Wyborn NR., et al., 2004 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6882-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1642 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023187 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023071 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000835 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A8W2 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01047 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A8W2 | ||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00598 | ||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023957 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01117 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50995 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416159 | ||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00347 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A8W2 | ||||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0A8W2 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A8W2 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1926 | 1720091 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | slyAp13 | 1720849 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [5] | ||
promoter | slyAp14 | 1720865 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [5] | ||
promoter | TSS_1927 (cluster) | 1720870 | reverse |
For this promoter, there Read more > |
[RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_1928 | 1720879 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | slyAp10 | 1721014 | reverse |
Similarity to the consensus Read more > |
[ICWHO] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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