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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | dgoR ![]() |
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Synonym(s): | ECK3687, G7789, b3694, b3695, b4479, yidW | |
Genome position(nucleotides): | 3874471 <-- 3875160 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.36 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0174108 | |
ECHOBASE: |
EB1669 | |
OU-MICROARRAY: |
b3694 | |
PortEco: |
dgoR | |
STRING: |
511145.b4479 | |
COLOMBOS: | dgoR |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional regulator DgoR | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | DgoR, YidW | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 26.08 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.397 | ||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||
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Classification: | |||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Evidence: | [APPINH] Assay of protein partially-purified from its native host [HIFS] Human inference of function from sequence [IDA] Inferred from direct assay [IEP] Inferred from expression pattern [IPI] Inferred from physical interaction |
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Reference(s): |
[1] Belliveau NM., et al., 2018 [2] Perez-Rueda E., et al., 2004 [3] Rigali S., et al., 2002 [4] Singh B., et al., 2019 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9435N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7790-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b4479 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011711 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008920 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000524 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P31460 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00392 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF07729 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P31460 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00035 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50949 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
YP_026239 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00345 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00895 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P31460 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P31460 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_4257 | 3875186 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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