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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | serS ![]() |
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Synonym(s): | ECK0884, EG10947, b0893 | |
Genome position(nucleotides): | 939428 --> 940720 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.67 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003038 | |
CGSC: |
169 | |
ECHOBASE: |
EB0940 | |
ECOLIHUB: |
serS | |
OU-MICROARRAY: |
b0893 | |
STRING: |
511145.b0893 | |
COLOMBOS: | serS |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | serine—tRNA ligase | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | SerRS, SerS | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 48.414 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.181 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A8L1 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35989N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
SERS-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0893 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR033729 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR042103 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015866 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR010978 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006195 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002317 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002314 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A8L1 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR43697 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
6R1M | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
6R1O | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02403 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00587 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A8L1 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00981 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023935 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50862 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415413 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A8L1 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A8L1 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1083 | 939353 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1085 | 939422 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1086 | 939441 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1087 | 939732 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1088 (cluster) | 939778 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1089 | 939783 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1090 | 940085 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1091 | 940406 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1093 | 940859 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1094 | 941064 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1095 | 941073 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1096 | 942273 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1097 | 942295 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1098 (cluster) | 943010 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |