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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | trmD ![]() |
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Synonym(s): | ECK2604, EG11023, b2607 | |
Genome position(nucleotides): | 2744572 <-- 2745339 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.39 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008576 | |
CGSC: |
76 | |
ECHOBASE: |
EB1016 | |
ECOLIHUB: |
trmD | |
OU-MICROARRAY: |
b2607 | |
STRING: |
511145.b2607 | |
COLOMBOS: | trmD |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | tRNA m1G37 methyltransferase | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | TrmD | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 28.422 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.588 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Ashtawy HM., et al., 2018 [2] Christian T., et al., 2004 [3] Gamper HB., et al., 2015 [4] Hou YM. 2016 [5] Wang H., et al., 2020 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A873 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-48264N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11023-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2607 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023148 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002649 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR016009 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029028 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029026 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A873 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR46417 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1P9P | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01746 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A873 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417098 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A873 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A873 | ||||||||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||
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Name: | rpsP-rimM-trmD-rplS | ||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2947 | 2744532 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | rplSp1 | 2744642 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | TSS_2948 | 2744644 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_2949 | 2744647 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_2950 | 2744657 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_2951 | 2744665 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] |
Reference(s) |
![]() |
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