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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rapA ![]() |
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Synonym(s): | ECK0060, EG11083, b0059, hepA, yabA | |
Genome position(nucleotides): | 60358 <-- 63264 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
54.9 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000198 | |
CGSC: |
29491 | |
ECHOBASE: |
EB1075 | |
ECOLIHUB: |
hepA | |
OU-MICROARRAY: |
b0059 | |
STRING: |
511145.b0059 | |
COLOMBOS: | rapA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | RNA polymerase-binding ATPase and RNAP recycling factor | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | HepA, RNA polymerase (RNAP)-binding ATPase and RNAP recycling factor, RapA, YabA | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 109.769 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.813 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IDA-PURIFIED-PROTEIN] Assay of protein purified to homogeneity | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Kansara SG., et al., 2011 [2] Kolsto AB., et al., 1993 [3] McKinley BA., et al., 2007 [4] Muzzin O., et al., 1998 [5] Rouby J., et al., 2002 [6] Salmelin C., et al., 2002 [7] Sukhodolets MV., et al., 2001 [8] Sukhodolets MV., et al., 2003 [9] Sukhodolets MV., et al., 1998 [10] Yohannes E., et al., 2005 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P60240 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35881N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11083-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0059 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR040765 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR040766 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR038718 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR027417 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023949 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR022737 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014001 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001650 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000330 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P60240 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
6BOG | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
4S20 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF18337 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF12137 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF18339 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00271 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00176 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P60240 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023677 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51194 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51192 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414601 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00490 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00487 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P60240 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P60240 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Translational |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | rluAp1 | 60450 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [11] | ||
promoter | TSS_116 | 62712 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [12] | ||
promoter | TSS_117 | 62992 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [12] | ||
promoter | TSS_118 | 63450 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [12] |
Reference(s) |
![]() |
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