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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | yadC ![]() |
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Synonym(s): | ECK0134, EG11678, b0135 | |
Genome position(nucleotides): | 149715 <-- 150953 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
40.36 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000470 | |
ECHOBASE: |
EB1629 | |
ECOLIHUB: |
yadC | |
OU-MICROARRAY: |
b0135 | |
STRING: |
511145.b0135 | |
COLOMBOS: | yadC |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | fimbrial tip-adhesin YadC | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | YadC | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | extracellular space,pilus | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 44.899 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.652 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Korea CG., et al., 2010 [2] Korea CG., et al., 2011 [3] Larsonneur F., et al., 2016 [4] Wurpel DJ., et al., 2013 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P31058 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-11181N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11678-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0135 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR017014 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000259 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036937 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008966 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P31058 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00419 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P31058 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414677 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P31058 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P31058 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | panCp4 | 148910 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [5] | ||
promoter | panCp2 | 148920 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [5] | ||
promoter | TSS_272 | 149617 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] |
Reference(s) |
![]() |
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