![]() ![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | lrhA ![]() |
|
Synonym(s): | ECK2283, EG12123, b2289, genR | |
Genome position(nucleotides): | 2405703 <-- 2406641 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
49.73 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007555 | |
CGSC: |
32685 | |
ECHOBASE: |
EB2044 | |
ECOLIHUB: |
lrhA | |
OU-MICROARRAY: |
b2289 | |
STRING: |
511145.b2289 | |
COLOMBOS: | lrhA |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator LrhA | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | GenR, LrhA | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | LysR | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 34.594 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.029 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence [EXP-IDA-PURIFIED-PROTEIN] Assay of protein purified to homogeneity [EXP-IEP-GENE-EXPRESSION-ANALYSIS] Gene expression analysis |
||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Bongaerts J., et al., 1995 [2] Gibson KE., et al., 1999 [3] Lehnen D., et al., 2002 |
||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P36771 | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12123-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2289 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005119 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000847 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P36771 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03466 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00126 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P36771 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00039 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50931 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416792 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P36771 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P36771 | ||||||||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_2564 | 2404729 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_2565 | 2405136 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_2566 (cluster) | 2405828 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_2567 (cluster) | 2406635 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_2568 | 2406641 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | TSS_2569 | 2407012 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | alaAp7 | 2407414 | forward | nd | [COMP-AINF] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|