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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | cspC ![]() |
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Synonym(s): | ECK1821, EG12204, b1823, msmB | |
Genome position(nucleotides): | 1907226 <-- 1907435 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
46.67 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0006070 | |
CGSC: |
35339 | |
ECHOBASE: |
EB2120 | |
ECOLIHUB: |
cspC | |
OU-MICROARRAY: |
b1823 | |
STRING: |
511145.b1823 | |
COLOMBOS: | cspC |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | transcription antiterminator and regulator of mRNA stability CspC | ||||||||||||||||||||
Synonym(s): | CspA family stress protein CspC, CspC, MsmB | ||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol,membrane | ||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 7.402 | ||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 7.541 | ||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-AINF-FN-FROM-SEQ] Automated inference of function from sequence [EXP-IDA] Inferred from direct assay [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Bae W., et al., 2000 [2] Kram KE., et al., 2020 [3] Longo F., et al., 2016 [4] Perez-Rueda E., et al., 2004 [5] Seong W., et al., 2020 [6] Shenhar Y., et al., 2009 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A9Y6 | ||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-36183N | ||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG12204-MONOMER | ||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1823 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012340 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR019844 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012156 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011129 | ||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002059 | ||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A9Y6 | ||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00313 | ||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A9Y6 | ||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00050 | ||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022340 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00352 | ||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51857 | ||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416337 | ||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00357 | ||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A9Y6 | ||||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0A9Y6 | ||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A9Y6 | ||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | rlmAp9 | 1907086 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] | ||
promoter | cspCp8 | 1907509 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [7] |
Reference(s) |
![]() |
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