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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | dxr ![]() |
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Synonym(s): | ECK0172, EG12715, b0173, ispC, yaeM | |
Genome position(nucleotides): | 193521 --> 194717 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.63 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000592 | |
ECHOBASE: |
EB2575 | |
ECOLIHUB: |
dxr | |
OU-MICROARRAY: |
b0173 | |
STRING: |
511145.b0173 | |
COLOMBOS: | dxr |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | Dxr, IspC, YaeM | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane,cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 43.388 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.881 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9484N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
DXPREDISOM-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0173 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003821 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036291 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013512 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013644 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR026877 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036169 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P45568 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR30525 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2EGH | ||||||||||||||||||
PDB: |
1T1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
3R0I | ||||||||||||||||||
PDB: |
3ANN | ||||||||||||||||||
PDB: |
3ANM | ||||||||||||||||||
PDB: |
3ANL | ||||||||||||||||||
PDB: |
1JVS | ||||||||||||||||||
PDB: |
1K5H | ||||||||||||||||||
PDB: |
1ONN | ||||||||||||||||||
PDB: |
1ONO | ||||||||||||||||||
PDB: |
1ONP | ||||||||||||||||||
PDB: |
1Q0H | ||||||||||||||||||
PDB: |
1Q0L | ||||||||||||||||||
PDB: |
1Q0Q | ||||||||||||||||||
PDB: |
1T1S | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13288 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02670 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF08436 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P45568 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022494 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414715 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P45568 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P45568 | ||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
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Name: | dxr-ispZU-cdsA | ||||||||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_332 | 192941 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | dxrp3 | 193335 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | dxrp4 | 193338 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | dxrp5 | 193411 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | dxrp1 | 193471 | forward | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | TSS_333 | 194269 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |
Reference(s) |
![]() |
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