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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ymdB ![]() |
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Synonym(s): | ECK1031, G6550, b1045 | |
Genome position(nucleotides): | 1105820 --> 1106353 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.69 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003549 | |
ECHOBASE: |
EB3633 | |
ECOLIHUB: |
ymdB | |
OU-MICROARRAY: |
b1045 | |
STRING: |
511145.b1045 | |
COLOMBOS: | ymdB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | 2'-O-acetyl-ADP-ribose deacetylase, regulator of RNase III activity | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | YmdB | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 18.88 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.525 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-48222N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G6550-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1045 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR024900 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043472 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002589 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1SPV | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CB5 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CB3 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CMS | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01661 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51154 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415563 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00506 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A8D6 | ||||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Translational |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | ymdBp3 | 1105714 | forward | nd | [ICWHO] | [1] | ||
promoter | ymdBp4 | 1105738 | forward | nd | [ICWHO] | [1] | ||
promoter | TSS_1326 | 1105797 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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