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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | truD ![]() |
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Synonym(s): | ECK2740, G7422, b2745, ygbO | |
Genome position(nucleotides): | 2870255 <-- 2871304 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
52.19 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0009011 | |
ECHOBASE: |
EB2912 | |
ECOLIHUB: |
truD | |
OU-MICROARRAY: |
b2745 | |
STRING: |
511145.b2745 | |
COLOMBOS: | truD |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | tRNA pseudouridine13 synthase | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | TruD, YgbO | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 39.091 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.532 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
Q57261 | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7422-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2745 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR042214 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043165 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020119 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR020103 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011760 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001656 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
Q57261 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1SI7 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1SB7 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1SZW | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01142 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
Q57261 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000024128 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS01268 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50984 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417225 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
Q57261 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
Q57261 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ispFp2 | 2871911 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [1] | ||
promoter | ispFp3 | 2871984 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [1] |