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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | yjiR ![]() |
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Synonym(s): | ECK4331, G7936, b4340 | |
Genome position(nucleotides): | 4570162 <-- 4571574 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.06 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0014232 | |
ECHOBASE: |
EB2466 | |
ECOLIHUB: |
yjiR | |
OU-MICROARRAY: |
b4340 | |
STRING: |
511145.b4340 | |
COLOMBOS: | yjiR |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | fused putative DNA-binding transcriptional regulator/putative aminotransferase YjiR | ||||||||||||||||
Synonym(s): | YjiR | ||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||
Molecular weight: | 53.047 | ||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.287 | ||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence | ||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Kingston AW., et al., 2015 [2] Perez-Rueda E., et al., 2000 [3] Perez-Rueda E., et al., 2004 |
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External database links: | |||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P39389 | ||||||||||||||||
ECOCYC: |
G7936-MONOMER | ||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b4340 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004839 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015422 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015421 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000524 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR015424 | ||||||||||||||||
MODBASE: |
P39389 | ||||||||||||||||
PFAM: |
PF00155 | ||||||||||||||||
PFAM: |
PF00392 | ||||||||||||||||
PRIDE: |
P39389 | ||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50949 | ||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_418760 | ||||||||||||||||
SMART: |
SM00345 | ||||||||||||||||
SMR: |
P39389 | ||||||||||||||||
UNIPROT: |
P39389 | ||||||||||||||||
RNA cis-regulatory element | ![]() |
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Attenuation: | Translational |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_5146 | 4569651 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] | ||
promoter | yjiSp3 | 4571705 | forward | nd | [COMP-AINF] | [5] | ||
promoter | yjiSp4 | 4571720 | forward | nd | [COMP-AINF] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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