![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | rodZ ![]() |
|
Synonym(s): | ECK2512, EG10015, b2516, yfgA | |
Genome position(nucleotides): | 2641831 <-- 2642844 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
54.54 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0008283 | |
ECHOBASE: |
EB0015 | |
ECOLIHUB: |
rodZ | |
OU-MICROARRAY: |
b2516 | |
STRING: |
511145.b2516 | |
COLOMBOS: | rodZ |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | cytoskeleton protein RodZ | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | RodZ, YfgA, transmembrane component of cytoskeleton | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 36.192 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.461 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IDA] Inferred from direct assay [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype |
||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Alyahya SA., et al., 2009 [2] Bendezu FO., et al., 2009 [3] Ikebe R., et al., 2018 [4] Jacques PE., et al., 2006 [5] Niba ET., et al., 2010 [6] Porter T., et al., 2016 [7] Shiomi D., et al., 2008 |
||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P27434 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-12034N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10015-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2516 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023690 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025194 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR010982 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001387 | ||||||||||||||||||||||||
MINT: |
P27434 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P27434 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13464 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13413 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P27434 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023803 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50943 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_417011 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00530 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P27434 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_2809 (cluster) | 2641405 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | ispGp1 | 2641880 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [9] | ||
promoter | TSS_2810 | 2641922 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2811 (cluster) | 2641929 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2812 | 2641933 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | ispGp4 | 2641950 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [9] | ||
promoter | ispGp5 | 2641954 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [9] | ||
promoter | TSS_2813 (cluster) | 2641985 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2814 (cluster) | 2641990 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2815 | 2641997 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_2816 | 2642045 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | rodZp1 | 2642932 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [9] | ||
promoter | rodZp2 | 2642934 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [9] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|