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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | arcA ![]() |
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Synonym(s): | ECK4393, EG10061, b4401, cpxC, dye, fexA, msp, seg, sfrA | |
Genome position(nucleotides): | 4639590 <-- 4640306 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.05 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0014434 | |
CGSC: |
831 | |
ECHOBASE: |
EB0059 | |
ECOLIHUB: |
arcA | |
OU-MICROARRAY: |
b4401 | |
STRING: |
511145.b4401 | |
COLOMBOS: | arcA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator ArcA | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | ArcA, ArcA response regulator, CpxC, Dye, FexA, Msp, Seg, SfrA, dye resistance protein | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | OmpR | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 27.292 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.978 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Evidence: | [COMP-AINF-FN-FROM-SEQ] Automated inference of function from sequence [EXP-IDA-PURIFIED-PROTEIN] Assay of protein purified to homogeneity [EXP-IEP-GENE-EXPRESSION-ANALYSIS] Gene expression analysis |
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Reference(s): |
[1] Alexeeva S., et al., 2003 [2] Cho BK., et al., 2006 [3] Drury LS., et al., 1985 [4] Pao GM., et al., 1995 [5] Parkinson JS. 1993 [6] Parkinson JS., et al., 1992 [7] Stock JB., et al., 1990 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A9Q1 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-36035N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
ARCA-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b4401 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011006 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001867 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001789 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR039420 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR016032 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A9Q1 | ||||||||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR48111 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1XHE | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1XHF | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00072 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00486 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A9Q1 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022123 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51755 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50110 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_418818 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00862 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00448 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A9Q1 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A9Q1 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_5187 | 4640243 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_5188 | 4640332 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_5189 | 4640338 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | yjjYp6 | 4640358 | forward | nd | [COMP-AINF] | [9] | ||
promoter | TSS_5190 (cluster) | 4640420 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_5191 | 4640424 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_5192 | 4640426 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] | ||
promoter | TSS_5194 | 4640530 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [8] |