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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | aspS ![]() |
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Synonym(s): | ECK1867, EG10097, b1866, tls | |
Genome position(nucleotides): | 1948750 <-- 1950522 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.75 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0006226 | |
CGSC: |
32508 | |
ECHOBASE: |
EB0095 | |
ECOLIHUB: |
aspS | |
MIM: |
611105 | |
OU-MICROARRAY: |
b1866 | |
STRING: |
511145.b1866 | |
COLOMBOS: | aspS |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | aspartate—tRNA ligase | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | AspRS, AspS, Tls | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 65.913 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.359 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Akesson B., et al., 1978 [2] Neuenfeldt A., et al., 2013 |
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-9182N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
ASPS-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1866 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004115 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004364 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004365 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004524 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006195 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012340 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029351 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002312 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P21889 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR22594:SF5 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1EQR | ||||||||||||||||||
PDB: |
1C0A | ||||||||||||||||||
PDB: |
1IL2 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01336 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00152 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02938 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P21889 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR01042 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022173 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50862 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416380 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P21889 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P21889 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2212 | 1948376 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_2213 | 1948462 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_2214 | 1949007 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_2215 | 1949515 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_2216 (cluster) | 1950222 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_2217 | 1950276 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | TSS_2218 | 1950278 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] | ||
promoter | yecDp8 | 1950636 | forward | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | yecDp7 | 1950760 | forward | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | yecDp4 | 1950778 | forward | nd | [ICWHO] | [4] | ||
promoter | TSS_2220 | 1950822 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [3] |
Reference(s) |
![]() |
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