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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | ddlB ![]() |
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Synonym(s): | ECK0093, EG10214, b0092, ddl | |
Genome position(nucleotides): | 102233 --> 103153 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.57 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000326 | |
CGSC: |
870 | |
ECHOBASE: |
EB0210 | |
ECOLIHUB: |
ddlB | |
OU-MICROARRAY: |
b0092 | |
STRING: |
511145.b0092 | |
COLOMBOS: | ddlB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | D-alanine—D-alanine ligase B | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | Ddl, DdlB | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 32.84 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.482 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Batson S., et al., 2017 [2] Besong GE., et al., 2005 [3] Hersch SJ., et al., 2020 [4] Kovac A., et al., 2008 [5] Kovac A., et al., 2007 [6] Lugtenberg EJ., et al., 1973 [7] Murakami R., et al., 2009 [8] Putty S., et al., 2011 [9] Skedelj V., et al., 2012 [10] Sova M., et al., 2009 [11] Vehar B., et al., 2011 [12] Wu D., et al., 2008 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P07862 | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
DALADALALIGB-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0092 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013815 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011761 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011127 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011095 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005905 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000291 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR016185 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P07862 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
4C5C | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
4C5B | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
4C5A | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2DLN | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1IOV | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1IOW | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF07478 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01820 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P07862 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022420 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00843 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50975 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00844 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414634 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P07862 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P07862 | ||||||||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
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Name: | mraZ-rsmH-ftsLI-murEF-mraY-murD-ftsW-murGC-ddlB-ftsQAZ-lpxC | ||||||||||||||||||||||||||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_172 | 100621 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_173 (cluster) | 102049 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_174 | 102679 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_175 | 102865 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_176 | 102872 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_177 | 103019 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_178 | 103024 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_179 (cluster) | 103028 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_180 | 103133 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_181 | 103608 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_182 | 103889 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] | ||
promoter | TSS_183 | 103960 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [13] |
Reference(s) |
![]() |
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