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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | lrp ![]() |
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Synonym(s): | ECK0880, EG10547, alsB, b0889, ihb, livR, lrs, lss, lstR, mbf, oppI, rblA | |
Genome position(nucleotides): | 932595 --> 933089 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
47.88 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0003023 | |
CGSC: |
549 | |
ECHOBASE: |
EB0542 | |
ECOLIHUB: |
lrp | |
OU-MICROARRAY: |
b0889 | |
STRING: |
511145.b0889 | |
COLOMBOS: | lrp |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator Lrp | ||||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | AlsB, Ihb, LivR, Lrp, Lrs, Lss, LstR, Mbf, OppI, RblA | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | AsnC | ||||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 18.887 | ||||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.092 | ||||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Cui Y., et al., 1995 [2] Ernsting BR., et al., 1992 [3] Haney SA., et al., 1992 [4] Willins DA., et al., 1991 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0ACJ0 | ||||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35825N | ||||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
PD00353 | ||||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0889 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR019887 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR019885 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011991 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011008 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000485 | ||||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR019888 | ||||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2GQQ | ||||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2L4A | ||||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01037 | ||||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF13412 | ||||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0ACJ0 | ||||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00033 | ||||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023126 | ||||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50956 | ||||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00519 | ||||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415409 | ||||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00344 | ||||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0ACJ0 | ||||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0ACJ0 | ||||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1060 | 932431 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1061 | 932507 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1062 | 932525 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1063 (cluster) | 933135 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1064 | 933181 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | ftsKp3 | 933218 | forward |
We assigned a putative transcription Read more > |
[COMP-AINF], [COMP-AINF-POSITIONAL-IDENTIFICATION] | [6], [7] | ||
promoter | TSS_1065 | 933716 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1066 | 934543 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1067 | 934547 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1068 | 934549 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1069 | 935748 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1070 | 936467 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1071 | 936562 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1072 | 936567 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1073 | 936589 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1074 | 936705 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1075 | 936711 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1076 | 936713 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1077 | 936735 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1078 | 936737 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] | ||
promoter | TSS_1079 | 936755 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [5] |
Reference(s) |
![]() |
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