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Gene | ![]() ![]() |
|
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Name: | nrdA ![]() |
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Synonym(s): | ECK2226, EG10660, b2234, dnaF | |
Genome position(nucleotides): | 2344865 --> 2347150 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.67 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007383 | |
CGSC: |
445 | |
ECHOBASE: |
EB0654 | |
ECOLIHUB: |
nrdA | |
OU-MICROARRAY: |
b2234 | |
STRING: |
511145.b2234 | |
COLOMBOS: | nrdA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit α | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | DnaF, NrdA | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 85.775 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.097 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-584N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
NRDA-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2234 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR039718 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013509 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000788 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005144 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008926 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013346 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P00452 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR11573 | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CNS | ||||||||||||||||||
PDB: |
4ERP | ||||||||||||||||||
PDB: |
7R1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
6W4X | ||||||||||||||||||
PDB: |
6R1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
5R1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CNV | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CNU | ||||||||||||||||||
PDB: |
5CNT | ||||||||||||||||||
PDB: |
1QFN | ||||||||||||||||||
PDB: |
1R1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
1RLR | ||||||||||||||||||
PDB: |
2R1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
2X0X | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAK | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAP | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAV | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAW | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAX | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAY | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XAZ | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XO4 | ||||||||||||||||||
PDB: |
2XO5 | ||||||||||||||||||
PDB: |
3R1R | ||||||||||||||||||
PDB: |
3UUS | ||||||||||||||||||
PDB: |
4ERM | ||||||||||||||||||
PDB: |
4R1R | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03477 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02867 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00317 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P00452 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR01183 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023402 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51161 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00089 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416737 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P00452 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P00452 | ||||||||||||||||||
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
---|---|
Display Regulation | |
Activated by: | CRP, ArgP, DnaA, Fis |
Repressed by: | H-NS, DnaA, NrdR |
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_2509 | 2344861 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2510 | 2344875 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2511 | 2345253 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2512 | 2345987 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2513 | 2346007 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2514 | 2347352 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |