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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rhsD ![]() |
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Synonym(s): | ECK0491, EG10849, b0497 | |
Genome position(nucleotides): | 523261 --> 527541 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
60.13 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0001724 | |
ECHOBASE: |
EB0842 | |
ECOLIHUB: |
rhsD | |
MIM: |
616736 | |
OU-MICROARRAY: |
b0497 | |
STRING: |
511145.b0497 | |
COLOMBOS: | rhsD |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | protein RhsD | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | RhsD | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | extracellular space,outer membrane | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 159.724 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 5.715 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IEP] Inferred from expression pattern | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Lin RJ., et al., 1984 [2] van der Ploeg JR., et al., 1996 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P16919 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-10702N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10849-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0497 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR025479 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR031325 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR022385 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006530 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001826 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF05593 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF20148 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03527 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF14220 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P16919 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00394 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023746 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415030 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P16919 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P16919 | ||||||||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||
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Name: | rhsD-ybbC-ylbH-ybbD | ||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | rhsDp8 | 523066 | forward | nd | [COMP-AINF] | [3] | ||
promoter | TSS_665 | 526934 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [4] |
Reference(s) |
![]() |
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