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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | rnhA ![]() |
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Synonym(s): | ECK0214, EG10860, b0214, cer, dasF, herA, rnh, sdrA, sin | |
Genome position(nucleotides): | 235535 <-- 236002 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
50.43 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000717 | |
CGSC: |
268 | |
ECHOBASE: |
EB0853 | |
ECOLIHUB: |
rnhA | |
MIM: |
616479 | |
OU-MICROARRAY: |
b0214 | |
STRING: |
511145.b0214 | |
COLOMBOS: | rnhA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | ribonuclease HI | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | Cer, DasF, HerA, RNase H, RNase HI, RNase HI, degrades RNA of DNA-RNA hybrids, participates in DNA replication, Rnh, RnhA, SdrA, Sin, type I RNase H | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 17.597 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.478 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A7Y4 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-47864N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG10860-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0214 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036397 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002156 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012337 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR022892 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A7Y4 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1KVC | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1LAV | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1LAW | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RBR | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RBS | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RBT | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RBU | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RBV | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RCH | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RDA | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RDB | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RDC | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RDD | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1RNH | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1WSE | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1WSF | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1WSG | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1WSH | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1WSI | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1WSJ | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2RN2 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2YV0 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2Z1G | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2Z1H | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2Z1I | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
2Z1J | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3AA2 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3AA3 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3AA4 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3AA5 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3HYF | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3QIN | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
3QIO | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
4Z0U | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1KVB | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1KVA | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1JXB | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1JL2 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1JL1 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1GOC | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1GOB | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1GOA | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1F21 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1G15 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00075 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A7Y4 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023795 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50879 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414750 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A7Y4 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A7Y4 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | yafSp2 | 234784 | forward | nd | [COMP-AINF] | [1] | ||
promoter | TSS_430 | 234785 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | gloBp5 | 234926 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [1] | ||
promoter | TSS_431 | 235937 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_432 (cluster) | 236020 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_433 | 236027 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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