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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | topA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1268, EG11013, b1274, supX | |
Genome position(nucleotides): | 1331048 --> 1333645 Genome Browser | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.77 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0004275 | |
CGSC: |
89 | |
ECHOBASE: |
EB1006 | |
ECOLIHUB: |
topA | |
OU-MICROARRAY: |
b1274 | |
STRING: |
511145.b1274 | |
COLOMBOS: | topA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA topoisomerase 1 | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | DNA topoisomerase I (omega; protein), SupX, TopA, Topo I | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 97.35 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.639 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-11011N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11013-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1274 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013497 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013263 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006171 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005733 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003602 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003601 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000380 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013498 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR034149 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013825 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013824 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR028612 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013826 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023405 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023406 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P06612 | ||||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR42785 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY7 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY6 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY4 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY2 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY1 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY0 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1MW8 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1MW9 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1YUA | ||||||||||||||||||
PDB: |
3PWT | ||||||||||||||||||
PDB: |
3PX7 | ||||||||||||||||||
PDB: |
4RUL | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY9 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CY8 | ||||||||||||||||||
PDB: |
1ECL | ||||||||||||||||||
PDB: |
1CYY | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01751 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01396 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF01131 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF08272 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P06612 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00417 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50880 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00396 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415790 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00493 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00436 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00437 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P06612 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P06612 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_1710 | 1330684 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1711 (cluster) | 1330687 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | yciNp10 | 1330689 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yciNp8 | 1330702 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | TSS_1712 | 1330714 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | yciNp9 | 1330757 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yciNp11 | 1330790 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | TSS_1713 | 1330791 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | yciNp5 | 1330803 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | TSS_1715 | 1331232 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1716 | 1331471 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1717 | 1332403 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1718 | 1333761 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1719 | 1334133 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1720 | 1334254 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_1721 | 1334325 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |
Reference(s) |
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