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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | topB ![]() |
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Synonym(s): | ECK1761, EG11014, b1763, mutR | |
Genome position(nucleotides): | 1844999 <-- 1846960 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.15 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0005869 | |
CGSC: |
29988 | |
CGSC: |
36749 | |
ECHOBASE: |
EB1007 | |
ECOLIHUB: |
topB | |
OU-MICROARRAY: |
b1763 | |
STRING: |
511145.b1763 | |
COLOMBOS: | topB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA topoisomerase III | ||||||||||||||||
Synonym(s): | MutR, TopB, Topo III | ||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||
Molecular weight: | 73.217 | ||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.287 | ||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||
Reference(s): |
[1] Bebenek K., et al., 1983 [2] Bernstein DA., et al., 2003 [3] Bichara M., et al., 2021 [4] DiGate RJ. 1999 [5] Gomez-Eichelmann MC., et al., 1995 [6] Hiasa H., et al., 1994 [7] Jarukanont D., et al., 2014 [8] Martel M., et al., 2018 [9] Martel M., et al., 2015 [10] Rydberg B. 1978 [11] Santos ME., et al., 1994 [12] Stockum A., et al., 2012 [13] Uematsu N., et al., 1997 [14] Usongo V., et al., 2016 [15] Usongo V., et al., 2008 [16] Zhang HL., et al., 1995 |
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External database links: | |||||||||||||||||
DIP: |
DIP-11012N | ||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11014-MONOMER | ||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1763 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003601 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023405 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR005738 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR006171 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013497 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013824 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013825 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013826 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000380 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023406 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR034144 | ||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR003602 | ||||||||||||||||
MODBASE: |
P14294 | ||||||||||||||||
PANTHER: |
PTHR11390 | ||||||||||||||||
PDB: |
1D6M | ||||||||||||||||
PDB: |
2O5C | ||||||||||||||||
PDB: |
2O59 | ||||||||||||||||
PDB: |
2O54 | ||||||||||||||||
PDB: |
2O19 | ||||||||||||||||
PDB: |
1I7D | ||||||||||||||||
PDB: |
2O5E | ||||||||||||||||
PFAM: |
PF01751 | ||||||||||||||||
PFAM: |
PF01131 | ||||||||||||||||
PRIDE: |
P14294 | ||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00417 | ||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000024084 | ||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00396 | ||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50880 | ||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416277 | ||||||||||||||||
SMART: |
SM00437 | ||||||||||||||||
SMART: |
SM00493 | ||||||||||||||||
SMART: |
SM00436 | ||||||||||||||||
SMR: |
P14294 | ||||||||||||||||
UNIPROT: |
P14294 | ||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||||||
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Name: | ydjA-selD-topB | ||||||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | ynjIp5 | 1844886 | reverse | nd | [ICWHO] | [17] | ||
promoter | ynjIp4 | 1844902 | reverse | nd | [ICWHO] | [17] | ||
promoter | ynjIp1 | 1845011 | reverse | nd | [ICWHO] | [17] | ||
promoter | TSS_2071 | 1847772 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [18] |
Reference(s) |
![]() |
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