![]() ![]() ![]() |
Gene | ![]() ![]() |
|
---|---|---|
Name: | xerC ![]() |
|
Synonym(s): | ECK3806, EG11069, b3811 | |
Genome position(nucleotides): | 3996287 --> 3997183 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
53.96 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0012448 | |
CGSC: |
30184 | |
ECHOBASE: |
EB1062 | |
ECOLIHUB: |
xerC | |
OU-MICROARRAY: |
b3811 | |
STRING: |
511145.b3811 | |
COLOMBOS: | xerC |
Product | ![]() ![]() |
||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name: | site-specific tyrosine recombinase | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | XerC | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 33.868 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.911 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||
Classification: |
|
||||||||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype | ||||||||||||||||||||||||
Reference(s): | [1] Blakely G., et al., 1991 | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0A8P6 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-726N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11069-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b3811 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR023009 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR044068 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013762 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011931 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011010 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR010998 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004107 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR002104 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0A8P6 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5DCF | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF02899 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00589 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0A8P6 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000024234 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51898 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51900 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_418256 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0A8P6 | ||||||||||||||||||||||||
SWISSMODEL: |
P0A8P6 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0A8P6 | ||||||||||||||||||||||||
Operon | ![]() ![]() |
||||
---|---|---|---|---|---|
Name: | yifL-dapF-yigA-xerC-yigB | ||||
Operon arrangement: |
|
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
promoter | TSS_4468 (cluster) | 3995868 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_4469 | 3995958 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_4470 | 3996295 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_4471 | 3996562 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_4472 | 3997751 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_4474 | 3998622 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] | ||
promoter | TSS_4475 | 3998664 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
---|---|