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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | pdhR ![]() |
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Synonym(s): | ECK0112, EG11088, aceC, b0113, genA, yacB | |
Genome position(nucleotides): | 122092 --> 122856 | |
Strand: | forward | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
55.82 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0000394 | |
CGSC: |
30488 | |
ECHOBASE: |
EB1080 | |
ECOLIHUB: |
pdhR | |
OU-MICROARRAY: |
b0113 | |
STRING: |
511145.b0113 | |
COLOMBOS: | pdhR |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | DNA-binding transcriptional dual regulator PdhR | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | AceC, GenA, PdhR, YacB | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Regulator Family: | GntR | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 29.425 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 6.427 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): | |||||||||||||||||||||||||
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [COMP-HINF-FN-FROM-SEQ] Human inference of function from sequence [EXP-IDA-PART-PURIFIED-PROTEIN] Assay of partially-purified protein [EXP-IDA-PURIFIED-PROTEIN] Assay of protein purified to homogeneity [EXP-IEP-GENE-EXPRESSION-ANALYSIS] Gene expression analysis |
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Reference(s): |
[1] Haydon DJ., et al., 1991 [2] Haydon DJ., et al., 1993 [3] Ogasawara H., et al., 2007 [4] Quail MA., et al., 1995 [5] Quail MA., et al., 1994 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P0ACL9 | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11088-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b0113 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036388 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR036390 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR011711 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR008920 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000524 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0ACL9 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5KVR | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
5TPM | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF07729 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00392 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0ACL9 | ||||||||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00035 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023501 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50949 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_414655 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00345 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00895 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P0ACL9 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0ACL9 | ||||||||||||||||||||||||
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
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Display Regulation | |
Activated by: | CRP, FNR |
Repressed by: | FNR, Cra, PdhR, BtsR |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_233 | 120916 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_234 (cluster) | 120919 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_235 | 120955 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_236 (cluster) | 121676 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_238 | 122852 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_239 | 122860 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_241 | 123388 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_242 (cluster) | 123471 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_243 | 124973 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_244 | 125226 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] | ||
promoter | TSS_245 | 125425 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [6] |
Reference(s) |
![]() |
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