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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | pdeA ![]() |
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Synonym(s): | ECK2389, EG11145, b2395, yfeA | |
Genome position(nucleotides): | 2515643 <-- 2517832 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
49.0 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007899 | |
ECHOBASE: |
EB1135 | |
ECOLIHUB: |
yfeA | |
OU-MICROARRAY: |
b2395 | |
STRING: |
511145.b2395 | |
COLOMBOS: | pdeA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeA | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | PdeA, YfeA | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 83.524 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.361 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
|
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-12011N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11145-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2395 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029787 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007895 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001633 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000160 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR035919 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043128 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00563 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF05231 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P23842 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50883 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50887 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416896 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00052 | ||||||||||||||||||
SMART: |
SM00267 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P23842 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P23842 | ||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2678 | 2514349 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2679 | 2517867 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | yfeAp5 | 2517869 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] | ||
promoter | yfeAp6 | 2517892 | reverse | nd | [ICWHO] | [2] |
Reference(s) |
![]() |
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