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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | pdeA ![]() |
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Synonym(s): | ECK2389, EG11145, b2395, yfeA | |
Genome position(nucleotides): | 2515643 <-- 2517832 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
49.0 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0007899 | |
ECHOBASE: |
EB1135 | |
ECOLIHUB: |
yfeA | |
OU-MICROARRAY: |
b2395 | |
STRING: |
511145.b2395 | |
COLOMBOS: | pdeA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeA | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | PdeA, YfeA | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | inner membrane | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 83.524 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 8.361 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P23842 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-12011N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11145-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b2395 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR001633 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007895 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000160 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR035919 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR043128 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029787 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF00563 | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF05231 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P23842 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50887 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS50883 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416896 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00267 | ||||||||||||||||||||||||
SMART: |
SM00052 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P23842 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P23842 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2678 | 2514349 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2679 | 2517867 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | yfeAp5 | 2517869 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [2] | ||
promoter | yfeAp6 | 2517892 | reverse | nd | [COMP-AINF] | [2] |
Reference(s) |
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