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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | lolB ![]() |
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Synonym(s): | ECK1197, EG11293, b1209, hemM, ychC | |
Genome position(nucleotides): | 1262877 <-- 1263500 | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
51.44 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0004059 | |
CGSC: |
31940 | |
ECHOBASE: |
EB1270 | |
ECOLIHUB: |
lolB | |
OU-MICROARRAY: |
b1209 | |
STRING: |
511145.b1209 | |
COLOMBOS: | lolB |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | outer membrane lipoprotein LolB | ||||||||||||||||||||||||
Synonym(s): | HemM, LolB, YchC | ||||||||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||||||||
Cellular location: | outer membrane,periplasmic space | ||||||||||||||||||||||||
Molecular weight: | 23.551 | ||||||||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 9.18 | ||||||||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: |
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Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||||||||
Evidence: | [EXP-IDA-PURIFIED-PROTEIN] Assay of protein purified to homogeneity [EXP-IMP] Inferred from mutant phenotype |
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Reference(s): |
[1] Hayashi Y., et al., 2014 [2] Matsuyama S., et al., 1997 [3] Nakada S., et al., 2007 [4] Pedebos C., et al., 2021 [5] Rao S., et al., 2020 [6] Svanberg Frisinger F., et al., 2021 [7] Tsukahara J., et al., 2009 [8] Wada R., et al., 2004 [9] Yokota N., et al., 1999 |
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External database links: | |||||||||||||||||||||||||
ALPHAFOLD: |
P61320 | ||||||||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-35933N | ||||||||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11293-MONOMER | ||||||||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1209 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR004565 | ||||||||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR029046 | ||||||||||||||||||||||||
MINT: |
P61320 | ||||||||||||||||||||||||
MODBASE: |
P61320 | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1IWM | ||||||||||||||||||||||||
PDB: |
1IWN | ||||||||||||||||||||||||
PFAM: |
PF03550 | ||||||||||||||||||||||||
PRIDE: |
P61320 | ||||||||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000023104 | ||||||||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS51257 | ||||||||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_415727 | ||||||||||||||||||||||||
SMR: |
P61320 | ||||||||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P61320 | ||||||||||||||||||||||||
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
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Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_1538 | 1260982 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] | ||
promoter | TSS_1539 | 1261162 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] | ||
promoter | TSS_1540 | 1261821 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] | ||
promoter | TSS_1541 (cluster) | 1263536 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] | ||
promoter | TSS_1542 | 1263675 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] | ||
promoter | TSS_1543 (cluster) | 1264894 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] | ||
promoter | TSS_1544 (cluster) | 1264899 | forward | nd | [RS-EPT-CBR] | [10] |
Reference(s) |
![]() |
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