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Gene | ![]() ![]() |
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Name: | fliA ![]() |
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Synonym(s): | ECK1921, EG11355, b1922, flaD, rpoF | |
Genome position(nucleotides): | 2001070 <-- 2001789 Genome Browser | |
Strand: | reverse | |
Sequence: | Get nucleotide sequence FastaFormat | |
GC content %: |
54.17 | |
External database links: | ||
ASAP: |
ABE-0006396 | |
CGSC: |
771 | |
ECHOBASE: |
EB1330 | |
ECOLIHUB: |
fliA | |
OU-MICROARRAY: |
b1922 | |
STRING: |
511145.b1922 | |
COLOMBOS: | fliA |
Product | ![]() ![]() |
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Name: | RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor | ||||||||||||||||||
Synonym(s): | sigma;28, FlaD, FliA, RpoF, sigma 28 factor, sigma F factor | ||||||||||||||||||
Sequence: | Get amino acid sequence Fasta Format | ||||||||||||||||||
Cellular location: | cytosol | ||||||||||||||||||
Molecular weight: | 27.521 | ||||||||||||||||||
Isoelectric point: | 4.965 | ||||||||||||||||||
Motif(s): |
![]() |
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Classification: | |||||||||||||||||||
Note(s): | Note(s): ...[more]. | ||||||||||||||||||
External database links: | |||||||||||||||||||
DIP: |
DIP-47959N | ||||||||||||||||||
ECOCYC: |
EG11355-MONOMER | ||||||||||||||||||
ECOLIWIKI: |
b1922 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007624 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007627 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR007630 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR012845 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013324 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR013325 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR014284 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR028617 | ||||||||||||||||||
INTERPRO: |
IPR000943 | ||||||||||||||||||
MODBASE: |
P0AEM6 | ||||||||||||||||||
PDB: |
6PMI | ||||||||||||||||||
PDB: |
6PMJ | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04539 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04542 | ||||||||||||||||||
PFAM: |
PF04545 | ||||||||||||||||||
PRIDE: |
P0AEM6 | ||||||||||||||||||
PRINTS: |
PR00046 | ||||||||||||||||||
PRODB: |
PRO_000022654 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00716 | ||||||||||||||||||
PROSITE: |
PS00715 | ||||||||||||||||||
REFSEQ: |
NP_416432 | ||||||||||||||||||
SMR: |
P0AEM6 | ||||||||||||||||||
UNIPROT: |
P0AEM6 | ||||||||||||||||||
Transcriptional Regulation | ![]() ![]() |
---|---|
Display Regulation | |
Activated by: | H-NS, FlhDC |
Repressed by: | NsrR, SutR, IHF, MatA, CsgD |
RNA cis-regulatory element | ![]() |
---|---|
Attenuation: | Transcriptional |
Elements in the selected gene context region unrelated to any object in RegulonDB | ![]() ![]() |
---|
Type | Name | Post Left | Post Right | Strand | Notes | Evidence (Confirmed, Strong, Weak) | References | |
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promoter | TSS_2258 | 2001544 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2259 | 2001807 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2261 | 2002392 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2262 | 2002401 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] | ||
promoter | TSS_2263 | 2003300 | reverse | nd | [RS-EPT-CBR] | [1] |